A ver... Te cuento desde mi experiencia con el Interrail:
Lo bueno del Interrail es que durante esos 3 días puedes coger tantos trenes como quieras. Yo en Bélgica (que era el Pase Benelux) en un día hice de Luxemburgo a Lieja, de Lieja a Maastricht y de Maastricht a Amsterdam. En estos casos sí sale rentable el Interrail/Europass, porque el coste de estos 3 trenes era casi superior al coste del billete de Interrail. Además, cogí otros trenes como Bruselas-Brujas; Bruselas-Amberes, Amberes-Gante, Gante-Bruselas y Bruselas-Luxemburgo. Si quieres mucha movilidad dentro de países relativamente pequeños como Suiza, Austria, el Benelux o Dinamarca el Interrail es fantástico.
En el caso de Italia, como han dicho, los trenes son bastante baratos, y es una locura coger 3 trenes en un día, por ejemplo, pues las distancias son bastante largas y lo hacen bastante poco factible. Si simplemente quieres conocer Roma, Florencia y Venecia no te compensa en absoluto el Europass. Si tienes pensado un viaje de conocer determinadas ciudades, creo que es una locura pagar lo que se paga por un Interrail, porque te sale muchísimo más barato cogerlos por separado.
En cuanto a Eslovenia, por experiencia propia, la red ferroviaria es bastante mediocre. Los trenes llegan, pero son unas carracas que tardan la vida entera en hacer un recorrido corto. Si simplemente quieres conocer Ljubljana, no tendrás mucho problema, pero si quieres ir a Maribor, Bled o Jesenice, puedes hacerte viejo antes de llegar a tu destino
Y en cuanto a Croacia, creo recordar que la red de trenes es bastante escasa y hay sitios donde no llega el tren. En Croacia es muchísimo mejor usar un coche de alquiler, pero para que te hagas una idea del follón que tienen montado, para llegar a Dubrovnik tienes que entrar a Bosnia y salir pasados unos 80kms con el consecuente pase fronterizo, etc. Eso sí, merece la pena por lo increíble de los lugares. Mírate las excursiones a las islas croatas, porque son una maravilla. Y bastante baratos ambos. Conste que de todo esto hablo sobre mi experiencia en 2007, en 5 años pueden haber cambiado muchas cosas.
A Grecia, almenos en tren, no te lo recomiendo, porque pueden ser unas 20h de tren perfectamente. Si puedes coger un avión desde Zagreb o Belgrado te ahorrarás sufrimiento y tiempo.
En cuanto a los vuelos de ryanair, los pasajes son facilísimos de sacar, e incluso los puedes sacar unas pocas horas antes del vuelo. Eso sí, hay que tener en cuenta varias cosas: necesitas imprimir la tarjeta de embarque antes de ir al aeropuerto, porque te cobran 40 euros si no la llevas; y el equipaje tiene unas medidas determinadas: antes de subir al avión tienes que hacerlo encajar dentro de una estructura con esas medidas, y si no entra o no sale, a pagar 40 euros más. Si contemplas todo esto, y encima tienes la suerte de aprovechar una oferta (ya sea de vuelos baratos o de rebaja o supresión de tasas) -las ofertas van saliendo cada X tiempo, solo hay que ir mirando frecuentemente-, es muy aconsejable viajar con estas compañías. Los aviones no son una maravilla, pero compensa el precio.